นักศึกษาฝึกงานสาขาวิชาวิทยาศาสตร์การแพทย์ สามารถเลือกมาฝึกงานที่สถาบันพยาธิวิทยาได้ โดยให้ต้นสังกัดทำหนังสือขอฝึกงานถึงสถาบันพยาธิวิทยา ซึ่งในปัจจุบันสถาบันพยาธิวิทยารับนักศึกษาฝึกงาน สาขาวิชาวิทยาศาสตร์การแพทย์ จาก 3 มหาวิทยาลัย ดังนี้

1. มหาวิทยาลัยบูรพา หลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาพยาธิวิทยากายวิภาค
2. มหาวิทยาลัยนเรศวร หลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาพยาธิวิทยากายวิภาค
3. มหาวิทยาลัยหัวเฉียวเฉลิมพระเกียรติ หลักสูตรวิทยาศาสตรบัณฑิต สาขาวิชาวิทยาศาสตร์การแพทย์